Разобрался! Проблема возникает если только в полномочиях добавить новые полномочия:
1) Главного распорядителя бюджетных средств
2) Главного администратора доходов бюджета
3) Администратора доходов бюджета
4) Распорядителя бюджетных средств.
Когда стоит только одно полномочие "Получателя бюджетных средств", то все секции на месте.
Проблему обошел, сначала оставил только одно полномочие "Получателя бюджетных средств", затем в секции Информация о юридическом лице, в ведении которого находится организация (вышестоящий участник бюджетного процесса) очистил поля, сохранил изменения и потом в секции Сведения о бюджете ручками прописал код главы и наименование организации! Все нормально сохранилось!
Подробнее...